Как сделано такое меню на html или js?

с помощью абсолютного позиционирования.

.menu_item {
  position: relative;
}
.menu_item:after {
  content: "";
  display: block;
  width: 5px;
  height: 5px;
  background-color: red;
  border-radius: 5px;
  position: absolute;
  left: 50%;
  transform: translateX(-50%);
  bottom: -5px;
}

Обработка EXcel таблиц на сайте, что советуете?

Через Google Docs

Как лучше указывать ссылку с точки зрения SEO?

ссылка которая ведет на коммерческую страницу того же сайта.

т.е. внутренние ссылки? тогда, наверное, анкорные лучше.

Прекратят ли индексироваться страницы в каталоге?

По идее, сами. Запрос удаления, вроде бы, только временный.
При запрете через robots.txt, гугл может выдавать страницы в поиске, если есть внешние ссылки. Поэтому лучше через ноиндекс, не закрывая в роботах (https://support.google.com/webmasters/answer/93710...

Как сделать редактируемыми в админке modx, выпадающий список?

1. добавить поля (tv) к какому-нибудь ресурсу (скорее всего, с помощью migx) и вывести в форме.
2. если это список услуг, для каждой из которых есть соответствующая страница, можно вывести заголовки этих страниц (или каcтомные поля - tv).

Большие объемы данных для сайта (50-100 ГБ, фотографии). Организация поиска среди них. Облачные хранилища или что-то другое?

если 1000 фоток в день, 50-100 Гб вам вряд ли хватит

Ленивая подгрузка страниц во всплывающем окне?

ajax

Gulp, less онлайн?

linux

Почему одинаковый шрифт отображается с разным начертанием?

profesor08, не, это один шрифт.
может, фолбек, но точно не дефолтный.

Нормальна ли предоплата при написании текстов с документов?

Развод. Точка.
Даже не обсуждается.
Старя уже схема, но действенная. Помню, лет 10 назад долго убеждал свою родственницу, что это кидалово. Денег оправлять не стала, но до конца так и не поверила.
Могут выступать якобы от лица известных издательств и т.п.

Почему все письма с сайтов на VPS с ISPmanager уходят в спам или не доходят?

в php фунции mail() в заголовке FROM я пишу info@домен.сайта, а в Яндекс.Почту приходит письмо в спам с фактическим адресом отправителя - example.com (на gmail вообще ничего не приходит),

фактический адрес не соответствует указанному.
проверьте почту администратора домена (например [e-mail], или укажите в панели нужную почту в настройках www-домена). Туда могут приходить письма от мэйлер-демона с указанием причин.

ну и со скриптом разберитесь, почему так.

Почему все письма с сайтов на VPS с ISPmanager уходят в спам или не доходят?

Как я понял, письма с сервера уходят. Но почта попадает в спам.
Причины этого могут быть разные:
Например, содержимое писем содержит какие-то признаки.
Или ip сервера в каком-то блэклисте (бывает)
Слегка снижает вероятность срабатывания спам-фильтра правильная настройка почтового домена и сервера (spf, dkim). Но это не даст эффекта при отправке через mail.
Поэтому лучше подключить домен к https://connect.yandex.ru/pdd/ и настроить на вп плагин для отправки через smtp.

Почему все письма с сайтов на VPS с ISPmanager уходят в спам или не доходят?

Nick Toot, а сколько их у вас?

Не знаю с чего начать изучение программирования, есть языки подходящие начинающим?

самым простым для изучения считается python
ну или php

Почему говорт что clip и mask лучше делать SVG, чем нативный CSS?

а поддержка IE/Edge?

Drupal 7 с темой Bootstrap. Главные пункты меню не срабатывают при клике. Как сделать чтобы срабатывали?

$options['attributes']['data-target'] = '#';
и эту строку можно на всякий случай закрыть

Drupal 7 с темой Bootstrap. Главные пункты меню не срабатывают при клике. Как сделать чтобы срабатывали?

как закомментировать: поставьте в начале строчки два слеша // и сохраните.
потом очистите кэш и посмотрите, сработало ли.

Drupal 7 с темой Bootstrap. Главные пункты меню не срабатывают при клике. Как сделать чтобы срабатывали?

ниже написал в ответе, какой файл можно отредактировать.

Drupal 7 с темой Bootstrap. Главные пункты меню не срабатывают при клике. Как сделать чтобы срабатывали?

в шаблоне надо поискать код меню и удалить этот атрибут data-toggle="dropdown".
уточните, какой именно шаблон bootstrap вы используете.

Drupal 7 с темой Bootstrap. Главные пункты меню не срабатывают при клике. Как сделать чтобы срабатывали?

меню на js? типа superfish? тогда в настройках модуля или меню надо смотреть по идее.