Я такое делал через Яндекс.Телефонию и Virtual Audio Cable

Решил вопрос с помощью: pdfminer, pdf2image, PIL
Нашел координаты нужного текста с помощью pdfminer, преобразовал в картинку с помощью pdf2image и с помощью PIL сделал обрезку нужной области ( прибавил к координатам значения )