Надо добавить пустые option c параметром selected, тогда они по умолчанию будут выбраны:
<select class="form-control" name="pos">
<option value="Choose one" selected>
<?php
for($i=0;$i<count($pos);$i++){
echo "<option name='$id'>".$pos[$i]['title_pos']."</option>";
}
?>
</select>
<label for="type">Payment type:</label>
<select class="form-control" name="type">
<option value="Choose one" selected>
<?php
for($i=0;$i<count($types);$i++){
echo "<option name='$id'>".$types[$i]['title_type']."</option>";
}
?>
</select>
Плюс еще я заметил ошибку в циклах: вы используете некую переменную $id и присваиваете его параметру name, но по логике это должно быть .$pos[$i]['id'] и $types[$i]['id'] с присвоением параметру value. Плюс можно открыть для себя цикл foreach:
<select class="form-control" name="pos">
<option value="Choose one" selected>
<?php foreach($positions as $position): ?>
<option value="<?= $position['id'] ?>"><?= $position['title_pos'] ?></option>
<?php endforeach; ?>
</select>
<label for="type">Payment type:</label>
<select class="form-control" name="type">
<option value="Choose one" selected>
<?php foreach($types as $type): ?>
<option value="<?= $type['id'] ?>"><?= $type['title_type'] ?></option>
<?php endforeach; ?>
</select>