<?php if ($counter == 4) { ?>
если counter == 4, 8, 12..... добавлялся класс clearfix<?php $counter = 0; ?>
<?php foreach ($categories as $category) { ?>
<?php $counter++; ?>
<div class="col-xs-6 col-sm-4 col-md-4 col-lg-3 catpr-all">
........
</div>
<?php if ($counter == 4) { ?>
<div class="clearfix"></div>
<?php } ?>
<?php } ?>
<?php if ($counter % 4 == 0) { ?>
<div class="clearfix"></div>
<?php } ?>
<?php } ?>