Добавь прозрачный блок на всю ширину и высоту экрана с position: absolute; z-index: 10000 и скрой его, на событие скрола показывай его , и потом опять скрывай.
После php прийдется все забыть и посмотреть совершенно с другой стороны. Читай документацию с офф сайта и разбирай как работают модули ну и само собой пиши код.
fs.exists('./your_app.exe', function (exists) { //проверка есть ли файл
if(exists) {
fs.readFile('./your_app.exe', function read(err, data) {
if (err) {
throw err;
}
console.log(data); // содержание файла
});
}
});