Александр

Первичная, вторичная... Не усложняйте.
Юзер должен быть как минимум в одной группе. Как максимум -- хоть во всех.

Я создаю пользователя user, к нему автоматически создается группа user.

Только если Вы не указываете группу при создании. Указали группу при создании юзера -- он пошел туда. Не указали, система создает группу с именем юзера автоматически, чтоб выполнить условие про "как минимум в одной группе".

Снимите в линухе галку "часы в UTC".

https://help.ubuntu.ru/wiki/davfs2
Монтируете и вперед.

https://keepass.info/ ?

Появилась потребность запустить Ubuntu, установленную на внешнем ССД

Прокиньте диск в виртуалку (VirtualBox например) и запустите.

Именно добавить?

echo "DOMAIN=domain.domain" >> /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0

vlc

Остановить демон hostapd, перезагрузиться.

Скорее всего, фича. Если в /etc/services порт отмечен - он идет в список сервисов.

Есть ли смысл в таком случае ставить Linux? Чтобы не так просто и не так легко было взломать локального админа.

https://habr.com/post/104536/
Гуглить по фразе "Single User mode linux".
В целом, если есть свободный доступ к машине: можно вертеть ее в любую сторону. И ничего толком не сделать. Ищите не как защититься, а как устранить пути обхода: невозможность загрузки со сменных носителей, по сети, с других дисков. Пароль на биос + физическое ограничение доступа к машине, сейф например.

ps ex | grep ices | grep ices2.conf | grep -v grep | awk '{print $1}'

стоит ли начинать погружение в linux с

gentoo
Kali Linux - это больше про готовый набор инструментов для пентеста и около того.
Как рабочая машина - вряд ли годится сходу. Узнать, что там как внутри - хватит gentoo на моменте "настроили какое-то графическое окружение". А дальше - любой пакетный дистрибутив по вкусу.

В чем причина?

В linux (и других *nix* скорее всего) текущая директория не входит в путь поиска исполняемых файлов дабы не натворить бед.
Указывайте путь через ./ (на 0 директорий выше) принудительно, либо полный путь от корня, либо перенесите/скопируйте бинарь в любую директорию, входящую в $PATH.

ps auxf

...по аналогии с последними версиями AIMP и чем ближе к нему тем лучше, потому что там, ИМХО, всё просто божественно.
... Попробовал ...

Попробуйте запускать AIMP с помощью wine.

Если к примеру ядро unix написано на Си, а процессор понимает только двоичную систему счисления, то как тогда всё это работает?

Компилятор, компиляция
Операционная Система