Если сайт настроен на https, т.е. установлен сертификат и заданы перенаправления, то в robots.txt указываете директиву Host:
https://имясайта.ru и при добавлении в Вебмастер
сразу добавляйте с https. Иначе потеряете время потом, пока Яндекс будет переобходить, склеивать, проверять.