библиотеку jquery убирать в футер не рекомендую. Т.к. все скрипты, которые работают на JQ, но до которых не размещена сама библиотека (пример которой в описании) работать не будут. Рекомендую использовать асинхронное выполнение таких скриптов:
С появлением стандарта HTML5 появилась возможность асинхронной загрузки скриптов, что существенно увеличивает скорость загрузки страницы. Использовать этот вариант проще простого — добавьте async или defer в описание скрипта:
<script async src="скрипт_1" type="text/javascript"></script>
<script defer src="скрипт_2" type="text/javascript"></script>
Убирать в футер, повторюсь не рекомендую.