1. Из того что я видел, патч это просто пакет заменяющий/редактирующий файлы приложения (заранее известно в каких директориях они хранятся). На ubuntu это решается debian пакетами, на прочих линуксах пакетами своего менеджера, на винде это 
msi, на маках это 
dmg
2. 
wiki + фрэймворки, например 
memcached, 
encache