В таком случае добавить Ivy или завести папку lib которая будет хранится в системе контроля версий и из которой буду собираться класспафы для jar\war\ear архивов, но это очень скверный способ конечно же.
1. да. насколько я это понимаю, причем скорее всего он выполянет операции замена\удаление\создание без операций редактирования. Единственный альтернативный вариант это патч на исходники как предлагается ниже и после патча пересборка проекта, но я так не делал, исходники на компьютере клиента это как-то избыточно, на мой взгляд.
Написано
Войдите на сайт
Чтобы задать вопрос и получить на него квалифицированный ответ.