Инга

Использовать QStackedWidget
ui_main.py:

from PyQt5 import QtCore, QtGui, QtWidgets

import sys

class Ui_Main(QtWidgets.QWidget):
    def setupUi(self, Main):
        Main.setObjectName("Main")
        Main.resize(800, 480)

        self.QtStack = QtWidgets.QStackedLayout()

        self.stack1 = QtWidgets.QWidget()
        self.stack2 = QtWidgets.QWidget()
        self.stack3 = QtWidgets.QWidget()

        self.Window1UI()
        self.Window2UI()
        self.Window3UI()

        self.QtStack.addWidget(self.stack1)
        self.QtStack.addWidget(self.stack2)
        self.QtStack.addWidget(self.stack3)

    def Window1UI(self):
        self.stack1.resize(800, 480)

        #PushButton1#
        self.PushButton1 = QtWidgets.QPushButton(self.stack1)
        self.PushButton1.setText("BUTTON 1")
        self.PushButton1.setGeometry(QtCore.QRect(10, 10, 100, 100))

        #PushButton2#
        self.PushButton2 = QtWidgets.QPushButton(self.stack1)
        self.PushButton2.setText("BUTTON 2")
        self.PushButton2.setGeometry(QtCore.QRect(150, 150, 100, 100))

    def Window2UI(self):
        self.stack2.resize(800, 480)
        self.stack2.setStyleSheet("background: red")

    def Window3UI(self):
        self.stack3.resize(800, 480)
        self.stack3.setStyleSheet("background: blue")

Main.py:

from PyQt5 import QtCore, QtGui, QtWidgets
from PyQt5.QtWidgets import QApplication, QMainWindow

import sys

from ui_Main import Ui_Main

class Main(QMainWindow, Ui_Main):
    def __init__(self, parent=None):
        super(Main, self).__init__(parent)
        self.setupUi(self)

        self.PushButton1.clicked.connect(self.OpenWindow1)
        self.PushButton2.clicked.connect(self.OpenWindow2)

    def OpenWindow1(self):
        self.QtStack.setCurrentIndex(1)

    def OpenWindow2(self):
        self.QtStack.setCurrentIndex(2)

if __name__ == '__main__':
    app = QApplication(sys.argv)
    showMain = Main()
    sys.exit(app.exec_())

По этому "книжному" примеру все должно быть ясно, как белый день. Все ui в одном файле, их обработчик во втором. По образу и подобию подгоняется под любой функционал. Сам с него начинал.