Павел: ну так у вас под буфер innodb выделено 512мб, оно их и отъедает честно. уменьшите значение до 256/128мб по своему усмотрению, только учитывайте что тогда база может медленнее работать т.к. не хватит памяти закешировать всё.
Так поставьте обычную RouterOS x86 с ISO'шника, от CHR отличается только ограничениями, в ROS лимит по соединениям туннелей, в CHR лимит по трафику на порт. Лицензии насколько я понял у них подходят друг к другу
вы не смотрите в логи