VestaCP?

Bash, цикл for:
ks@archpc:[~/tmp/move]: for i in `ls ./for/`; do mv ./for/$i ./to/; done

Если это centos, то там пользователь apache.

Изначально не правильно делаешь) не стоит вешать thin на 80 порт. Гугли на тему nginx + supevisord + unicorn/thin/uwsgi. Я для себя выбрал последнего.