OpenOffice же есть - большинство офисных форматов вполне адекватно переваривает. Да, в каких-то специфических случаях могут быть косяки - ну, тут ничего не поделать. Еще есть отличнейшая тулза
PDFCreator - но, оно только для винды, есть серверные версии, в т.ч. сервис конвертации. Обычная бесплатная версия вполне адекватно переваривает все популярные форматы, работает в командной строке.