Django не является CMS. Это не джумла, и не вордпресс. Здесь нет отговорок типа "мне лень это писать". Ставим treebeard или mptt, реализуем модель комментариев. При необходимости, делаем REST интерфейс для вывода дерева, в JS добавляем возможность при клике на "ответить" выставлять id комментария в переменную. Открываем tinymce/ckeditor, при сабмите отправляем id родителя и текст сообщения.
django-threadedcomments реализует только модель и кучу templatetags. Абсолютно не django way. Как вы собрались решать проблему, если вам банально лень открыть анализатор запросов и посмотреть что отправляется на сервер? Почему не уходит parent_id?