Исходя из того, что я понял из того, что мне объяснили в ТП Яндекса (занятный каламбур):
они не сохраняют файл в буквальном смысле. Они создают новый файл с данными из полученного.
И по некоторым слухам дополняют его еще и чем-то своим. Поэтому технически дата изменения не может остаться прежней.
Бесит неистово.