PHP выполняется на сервере, а Javascript на клиенте. jQuery — это библиотека для javascript, которая позволяет делать некоторые вещи проще, например отсылать запрос на сервер без перезагрузки страницы. Такой подход к построению веб-приложения называется Ajax.
Чтобы динамически обновлять контент, нужно отправлять запрос на сервер, а затем полученные данные вставлять куда требуется.
Для отправки запроса используй jQuery.ajax(), для обработки запроса на сервере и возврата данных используй PHP, когда данные поступили клиенту (В Callback метода .ajax) используй jQuery, чтобы обновить содержимое какого-либо блока.
