Vintric

Если вы метите в джуниоры, то вам нужно несколько изменить порядок книг в вашей очереди.

Отложите алгоритмы и TDD на последнюю очередь -- это безусловно очень важные темы, но для вашей цели не первоочередные.
Познакомьтесь с паттернами (GoF) и "Рефакторингом" Фаулера.
Прочитайте вдумчиво английское издание Effective Java Джошуа Блоха. Не загромождайте (поначалу) голову паззлерами.
Ну и, наконец, сформируйте то, что нужно работодателю -- кругозор. Получите представление о вещах, вращающихся вокруг Java. Вот вам набор ключевых слов: Java Collections Framework, Java EE, Spring Framework, Maven, Glassfish, JDBC... Не нужно углубляться. Осознайте, что это такое. Изучите туториалы.

Я считаю, для поставленной цели этого достаточно.

Проблема в «живности», не обязательно вирусы. Нужно экспериментивовать — отключить все с автозагрузки, а потом включать по-одному, после чего начнется — то и виновато. Наиболее вероятно: Хромбаузер, майлру агент или защитник, вконтакте агент, яндекс защитнык, браузеры, тулбары, менеджеры загрузок… Просмотрите список установленного софта — удалите лишнее (если разбираетесь что лишнее)