Vindicar

Потому что у тебя в вызываемом файле делается повторная инициализация приложения.
Весь этот вот код

app = QtWidgets.QApplication([])
application = X() #где X - имя класса формы
application.show()

sys.exit(app.exec())

выполняется как при прямом запуске файла, так и при его импорте.

Есть два решения:
а) убрать код инициализации из вспомогательных файлов, оставить его ТОЛЬКО в главном файле.
б) если позарез нужно, чтобы вспомогательные файлы можно было запускать сами по себе без главного, то заверни этот код в конструкцию вида

if __name__ == '__main__':
    #тут код, который будет выполняться
    #ТОЛЬКО если файл запущен сам по себе
    #и не будет выполняться, если этот файл импортируют

Учи, что такое конечные автоматы, и как их реализовывать. По сути, это тебе даст необходимую базу для реализации игры. Каждый сюжетный шаг будет состоянием, а действия игрока - переходами.

Есть несколько способов их реализации, хорошо подумай, какой удобнее. Например, вариант с матрицей переходов будет работать плохо.

subprocess.Popen.communicate() же, не?

Учи, как работает асинхронное программирование.
Если на пальцах: всякий раз, когда ты делаешь await чтототам, выполнение асинхронной функции (вроде обработчика события) приостанавливается, и передаётся другой.
А вот код в промежутке между await вызовами (ну или началом-концом функции) выполняется непрерывно, и занимает поток управления. Пока этот код выполняется, остальной бот стоит!
Теперь посмотри что у тебя:

while (True):
            user.balance += user.s9 * 30
            time.sleep(30)
            user.save()

time.sleep() понятия не имеет про асинхронность, и не отдаёт управление другим асинхронным функциям. Поэтому пока она выполняется, остальной бот стоит.
Да, даже для одного пользователя.

Как минимум, нужно исправить две вещи.
1. используй await asyncio.sleep() вместо time.sleep(). asyncio.sleep() знает про асинхронность, и приостановит функцию с передачей управления, т.е. бот сможет делать что-то ещё пока эта функция ждёт.
2. while (True) - это не тру. Предусмотри код выхода из цикла! Или по максимальному числу итераций, или по команде, или по смене статуса пользователя... или по всему вышеперечисленному.

Судя по тегам discord и python, хотите использовать discord.py?
В таком случае, нужно обрабатывать событие на простановку реакции, добыть id юзера, который её проставил, отправить сообщение этом юзеру по его id.

Самые азы работы с библиотекой тут.

Модуль threading в помощь.
Кроме того, стоит запоминать, было ли найдено лицо на предыдущем кадре. Если на предыдущем не было, а на текущем есть, и если поток не активен, запускаем поток.

Лучше так не делать от слова совсем.
Либо пусть ваша функция возвращает это значение, либо сделайте её методом в классе, а локальную переменную замените на поле класса.

https://letmegooglethat.com/?q=python+make+directory
Кроме шуток, ответ легко ищется поисковиком!
В первой же паре строк будет os.mkdir() (для подкаталога в уже существующей директории) и os.makedirs() (для создания иерархии каталогов).

метод reshape() возвращает версию массива с другими размерами, а не меняет эти размеры на месте.
Так как вы игнорируете возвращаемое значение, вы пытаетесь повернуть одномерный вектор.
Но там ещё будут проблемы с sorted(arr_b), так как sorted() интерпретирует двумерный массив как коллекцию одномерных, и пытается сортировать только эту коллекцию.