Что делать с данным отступом Bootstrap?

Taron4uk, У вас для этого элемента стоит col-3. Поменяйте на col-auto, и у row уберите no-gutters.

Допустимо ли использование нескольких .container в одном блоке?

Сергей delphinpro, Двойной внутренний отступ вы можете сварганить добавив класс py. Например py-1, py-2 и т.д. Вставлять col в col для создания отступа, совсем не разумно.