Сам вопрос задал сам и отвечу. Нужно скомпилировать питон-код в си-код, с помощью cython. А потом си-код скомпилировать в .exe. Информацию нашел здесь -
python-3.ru/page/python-code-compile . Только там рассматривается способ компиляции в .pyd, но не суть важно. Ведь в интернете думаю есть инфа как скомпилировать си-код в .exe(Вот ссылка на туториал СИ в EXE -
https://msdn.microsoft.com/ru-ru/library/bb384838.aspx ). Всем спасибо за ответы и потраченное на меня время. Надеюсь эта тема поможет не только мне.