Новая версия должна знать, какие конкретно языки в ней добавились, и если вновь добавленный язык является системным у пользователя, выводить окно выбора языка при первом запуске обновленной версии с дополнительным объяснением:
У нас добавился язык %LanguageName%, не хотите ли его выбрать?
Остальная логика не меняется.