1. По вопросу, "Передаресация с http на https" и "Переадресация с www. на https://сайт.ru"
Оказалось, что у каждого хостера эти правила пишутся по своему (у меня тайм веб).
В моем случае мне подошли вот эти:
RewriteBase /
RewriteCond %{HTTP:X-HTTPS} !1
RewriteRule ^(.*)$
https://%{HTTP_HOST}/$1 [R=301,L]
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www\.сайт\.ru$ [NC]
RewriteRule ^(.*)$
https://сайт.ru%{REQUEST_URI} [L,R=301]
2. Что касается вопроса по определению яндексом главного зеркала, подожду немного, надеюсь ответ от Arik Arik будет верным и все само встанет на свое места
