Не до конца ясно что и откуда пропало, но папка
FOUND.000 (и подобные) - это обычно результат работы check disk.
Chkdsk - это такая волшебная программа, для которой отсутствие ошибок в файловой системе гораздо важнее данных, которые на той файловой системе хранятся. Соответственно, эта проверка диска вполне могла покрошить ваши файлы, устраняя ошибки ФС.
Если диски, с которых пропали данные, не системные, т.е. Windows на них ничего не пишет, то скачайте бесплатный
R.saver, это программа для восстановления файлов. Скачивайте и распаковывайте на диск C (на те, откуда пропало, записывать ничего нельзя) и сделайте полное сканирование дисков D и E.
Начните с того диска, откуда переносили. Найденное сохраняйте куда-то ещё - на третий диск, т.к. с двух дисков вероятность достать нужные файлы выше, и надо просканировать оба до какой-либо записи на них.
