Даниил Вершинин

Поставил вот такой костыль, но все-таки хочется узнать как правильно эту задачу решить

Ну, подключая скрипт на сайт, он действительно подгружается из сервиса. Скорее всего, для того, чтобы все работало, необходимо прописать уникальный класс или id для блока, который даст скрипту "понять" что превратить в попап

Чтение туториалов по актуальным (для Вас) проблемам

Можно. Но лучше на PHP! Ибо надежнее.