Здравствуйте! Опции иконки задавались для всей коллекции GeoObjectCollection, что перезатирало настройки отдельных меток.
Исправления:
1. Убрал GeoObjectCollection.
2. Добавил параметры иконки напрямую в каждую Placemark.
3. Указал опции метки в правильном месте.
Теперь балуны открываются по клику.
Пример исправленного кода собрал в песочнице jsfiddle:
https://jsfiddle.net/ro2dbLk0/1.