ThunderCat

Ну, иногда нужно быть детективом )
1) скопируйте файл который выполняется в папку, проверьте если он открывается оттуда(соответственно дело может быть в файле, кодировка или еще что-то)
2) Переименуйте .htaccess в .htaccess_ (проверьте что проблема не в .htaccess), так же и в папках, если есть.
3) Положите в папку файл index.php и попробуйте указать просто путь до папки в урл, возможно что где то в настройках стоит ноиндекс(емнип бывает и так)
4) Есть подозрение что вы открываете файлы "из других папок" не через урл, а через путь типа c:\server\localhost\myfolder\some.php , тогда конечно же интерпретироваться ваши файлы не будут, тупо откроются как хтмл.

date('Y-m-d', strtotime($thisDate. " - 5 day"));

чет не очень понятно что вообще вы делаете
Сначала вы создаете форму, в ней селектор и потом (внезапно) ссылку с гет параметрами...
Вероятно там просто вместо ссылки должна быть кнопка типа submit, тогда все будет логично.

есть 2 варианта:
1) передавать в ваш инпут строку типа "название_ид_тип" и на сервере обратно разбить и обработать. Решение так себе, например есть косяк с тем что имя вполне может содержать "_", но позволяет вам не сильно менять логику.
2) выводить выпадающий список не селектом, а нормальным списком(див или ул), в дата атрибуты которого прописать соответствующие данные(имя, ид, тип), по клику в 3 поля формы разносить эти данные и получить нормальную форму.

пагинатор это что? И фильтр это что?
От реализации зависит естественно, в нормальной архитектуре пэйджинг только определяет текущую страницу, может еще определять количество итемов на странице, к запросам отношения не имеет практически никогда.

форма action которая ведет на файл php

1) Если вы уберете "файл php" из экшна, фрома будет субмититься на текущий урл, что как раз будет давать вам перезагрузку. Естественно код отправки данных на емэйл тоже надо будет расположить в текущем скрипте.
2) Отправляйте данные аяксом через яваскрипт, после чего перегружайте страницу из яваскрипта.

В первом варианте есть нюанс - обновление страницы после субмита методом пост вызывает не совсем юзерфрендли поведение, предлагая снова отправить данные. Обычно после такой загрузки формы делают редирект на нужную страницу методом гет, это решает проблему.

Нужно понимать что если пользователь не авторизирован (то есть эта функция доступна любому зашедшему на сайт) то реализовать подобное технически нереально. Можно максимально затруднить процесс, но полностью решить проблему нет возможности.
Методы затруднения тут перечислили в основном, я коротко пробегусь по основным:
1) Куки - самый базовый метод, плюсы - простая реализация, для обычных пользователей работает весьма надежно. Минусы - легко обходится любым пользователем который знает как почистить куки или сменой браузера.
2) Эверкуки - продвинутые методы хранения меток на стороне клиента, там целый набор методов, читайте доку к библиотеке. плюсы - простой чисткой кукисов уже не лечится, минус - нужно дополнительно заморочиться, ну и смена браузера емнип сводит все на нет.
3) Фингерпринты - тема обширная, решение достаточно надежное, но основано на статистике, то есть имеет погрешность, которая много от чего зависит. Плюс - хорошо работает в качестве идентификатора, минус - может давать ложные срабатывания и опять же - смена браузера сильно снижает эффективность метода.