Дмитрий

Установить по сети с помощью PXE

Смотрите iotop

В общем случае всё важное только в home. На случай обновления ядра - лучше не удалять старое ядро пару недель, что бы на случай каких либо проблем можно было загрузиться со старым ядром.

0) Обязательно(!) сделать полный бекап.
1) Запустить утилиту mintupdate и обновиться до mint 18.
2) проверить что всё работает