TaN

Имеется абсолютно такая же проблема. Так же nginx перестаёт отвечать при ротации логов.
Причину найти так и не смогли.

Я больше ничего посоветовать не могу, увы.

Первым делом сделать бэкап, потом выполнить команду
# zpool clear %pool_name%
которая убирает флаг наличия ошибок с пула и даёт его инициализировать.
Копировать всё что можно