StrangeDylan

pyinstaller --onefile my_main.py my_functions.py

1. heroku не может не работать.
если у вас есть какие-либо проблемы с ним - публикуйте новый вопрос, с подробным описанием и со всей нужной информацией.
2. по вопросу, лучший вариант из бесплатных - repl.it + UptimeRobot.
подробнее об использовании: https://qna.habr.com/answer?answer_id=1841587#answ...

Нашел вот здесь

from threading import Thread
import time
import os

answer = None

def ask():
    global start_time, answer
    start_time = time.time()
    answer = input("Enter a number:\n")
    time.sleep(0.001)


def timing():
    time_limit = 5
    while True:
        time_taken = time.time() - start_time
        if answer is not None:
            print(f"You took {time_taken} seconds to enter a number.")
            os._exit(1)
        if time_taken > time_limit:
            print("Time's up !!! \n"
                  f"You took {time_taken} seconds.")
            os._exit(1)
        time.sleep(0.001)

t1 = Thread(target=ask)
t2 = Thread(target=timing)
t1.start()
t2.start()

https://stackoverflow.com/a/6087515/8148543

input - синхронная функция, она блокирует event loop. Для работы с консолью можно использовать асинхронную функцию ainput из модуля aioconsole.

import asyncio
from aioconsole import ainput

async def main():
  s = await ainput('Enter something: ')
  print (f"You entered {s}")

loop = asyncio.get_event_loop()
loop.run_until_complete(main())