У нас в компании есть тайм-трекер мониторят всех офисных сотрудников, явного негатива от этого я не разу не славливал. Тут больше все зависит от адекватности руководства. На данном этапе я бы дергаться не стал, а вот если станет невыносимо, то естественно отчаливать от такой компании подальше и забыть как страшный сон. На данном этапе такие штуки оцениваю нейтрально, но для фрилансеров думаю они могут и быть и полезными если у вас оплата по часам например. Так что на мой взгляд рано делать выводы, устанавливайте и дальше смотрите по ситуации.