Нашел решение, может кому понадобится.
add_filter('wpseo_breadcrumb_single_link' ,'hotel_remove_shop', 10 ,2);
function hotel_remove_shop($link_output, $link ){
if( $link['text'] == 'Товары' ) {
$link_output = '';
}
return $link_output;
}
Где : Товары - ссылка которую нужно удалить.