Linux с которым ни разу не сталкивался за 20 лет
А Вы точно из IT? :)
Файловый сервер - это скорее всего samba
Почитать стоит также о правах на файлы, о iptables, о дистрах и разнице между ними (как минимум deb-based и rpm-based).
Почитать что такое SSH и доступ к серверу по ключам. Скачать и пощупать какой-нить putty.
Команды нужные гуглятся за секунды, но какойнить "Карманный справочник по командам Linux" можно и почитать.