Создайте в корневом каталоге файл Procfile, в нем введите следующее:
worker: python bot.py
Потом в командной строке в рабочем каталоге включите worker:
heroku ps:scale worker=1
в остальном деплой мало отличается от привычного деплоя веб-приложения на heroku, который описан в справке.