Если я правильно понял, вам поможет только централизованная работа с бранчами. У нас в проекте никто не работает с транком, в транке подобные файлы имеют стандартную конфигурацию. А уже каждый разработчик работая на своем бранче, меняет эти конфиг файлы под себя. На сколько знаю в svn нельзя сделать так как вы хотите, разве что написать свои хитрые хуки на сервер, который будет если что ревертить такие файлы на транке или что-то такое. Но ИМХО это уже как-то извратненько.
