Aleksej

на ум приходят приложения симулирующие клик по GUI.
Это имеет мало отношения к программированию, хотя..... хотя там можно писать целые скрипты с анализом окна программы, условными переходами и т.д.
Не назову вам конкретных названий - сам не пользовался.

Не совсем понял некоторые ваши требования.
Но для отчетов, да еще и .Net отлично подойдет SSRS - MS SQL Reporting Services.
Есть и превью, и в программу можно встроить, есть экспорт в любые форматы - PDF, Word, Excel.
Можно использовать поставляемый ReportServer (Web Portal) или сделать свои web-страницу/программу.

Непонятно про "парсинг шаблонов" - вы про данные или про внещний вид отчета?
Данные в SSRS можно брать из любой БД или подставлять программно. Внешний вид формируется заранее.

Если Windows, то:
- уже упомянутый WPF (с обязательным применением MVVM)
- написание WinServices
Кроме того не оставляйте в стороне:
- ADO.NET и работа с БД, в самой простейщей форме. Без БД не обойдется ни одна корпоративная программа.