Возможно, вы заливаете фотографии которые имеют EXIF данные, в которых указана ориентация при создании фото. Вам нужно прочитать данные с помощью этой функции (если обработка идет на php) и под корректировать их, а потом изменять само изображение(ресайз, кроп и т.д.).