Немного поигрался в IE8 и нашел решение. Для тех, кто не понял, выложу пример за автора (который то ли поленился, то ли...). Разумеется без jQuery :)
<!DOCTYPE html>
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<title>Sample</title>
<!--[if lt IE 9]>
<script src="http://html5shiv.googlecode.com/svn/trunk/html5.js"></script>
<![endif]-->
</head>
<body>
<nav class="demo">
1
</nav>
<div>
2
</div>
<script>
document.querySelector('body').appendChild(document.querySelector('nav').cloneNode(true));
console.log(document.querySelectorAll('nav')[1]);
document.querySelector('body').appendChild(document.querySelector('div').cloneNode(true));
console.log(document.querySelectorAll('div')[1]);
</script>
</body>
</html>
В итоге в консоли видим:
ЖУРНАЛ: undefined
ЖУРНАЛ: [object HTMLDivElement]
Если ie не хочет по хорошему, то мочим его его же оружием:
<!DOCTYPE html>
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<title>Sample</title>
<!--[if lt IE 9]>
<script src="http://html5shiv.googlecode.com/svn/trunk/html5.js"></script>
<![endif]-->
</head>
<body>
<nav class="demo">
1
</nav>
<div>
2
</div>
<script>
document.querySelector('body').innerHTML+=document.querySelector('nav').outerHTML;
console.log(document.querySelectorAll('nav')[1]);
document.querySelector('body').appendChild(document.querySelector('div').cloneNode(true));
console.log(document.querySelectorAll('div')[1]);
</script>
</body>
</html>
В консоли видим:
ЖУРНАЛ: [object HTMLGenericElement]
ЖУРНАЛ: [object HTMLDivElement]
P.S. На будущее выкладывайте готовые примеры без всяких jQuery и прочих хрени.