При открытии Google Chrome на главной всплывает окно авторизации прокси.?

Chrome пользуется системным прокси. Искать надо в сетевых настройках ОС. (Windows, Linux, к сожалению не написано). Либо, как тут советовали выше, в расширениях.

Стоит ли изучать freebsd?

CityCat4,

Вы всерьез собираетесь обьяснять руководству, что вот мы берем это, а не то только потому что оно работает под FreeBSD?

Только так это и делается в нормальных конторах - "мы берем это железо для этого".