Столкнулся с это проблемой вчера, но быстро нашел причину...
Может кому поможет, я удалил папку PerfLogs в корне системного диска.
Это повлекло за собой новый сбор данных Функции Prefetch/Superfetch.
Как начался сбор данных, моя система стала потреблять 90-100% диска.
Итак, мой вывод:
Если уж ставить Windows 8.1, то только на пустой отформатированный диск.
Диск не будет нагружен, файлы будут размещены в нужном ПОРЯДКЕ на диске и логи будут собраны быстро.
Почему не помогает переустановка:
Если папка PerfLogs была удалена, новая система детектирует прежнюю Windows 8/8.1 и требует наличие этой папки.
Если папка отсутствует, данные собираются заново уже новой системой, что и вызывает нагрузку.
Решение: Переустановить систему на чистый диск, или же отключить Superfetch.
Поправьте меня, если я ошибся.