1. Проверьте, указан ли компонент в предзагрузке bootstrap
2. Попробуйте указать у цели значения flushInterval и exportInterval равными 1, например:
'log' => [
'flushInterval' => 1,
'targets' => [
[
'class' => 'yii\log\FileTarget',
'exportInterval' => 1,
],
],
],