Roman-G

Надо добавить use и обязательные поля, помеченные как TreeLeft, TreeRight, TreeLevel и т.д.

use Gedmo\Mapping\Annotation as Gedmo;
use Doctrine\ORM\Mapping as ORM;

/**
 * @Gedmo\Tree(type="nested")
 * @ORM\Table(name="Tree")
 * @ORM\Entity(repositoryClass="Gedmo\Tree\Entity\Repository\NestedTreeRepository")
 */
class Tree
{
    /**
     * @ORM\Column(name="id", type="integer")
     * @ORM\Id
     * @ORM\GeneratedValue
     */
    private $id;

    /**
     * @Gedmo\TreeLeft
     * @ORM\Column(name="lft", type="integer")
     */
    private $lft;

    /**
     * @Gedmo\TreeLevel
     * @ORM\Column(name="lvl", type="integer")
     */
    private $lvl;

    /**
     * @Gedmo\TreeRight
     * @ORM\Column(name="rgt", type="integer")
     */
    private $rgt;

    /**
     * @Gedmo\TreeRoot
     * @ORM\Column(name="root", type="integer", nullable=true)
     */
    private $root;

    /**
     * @Gedmo\TreeParent
     * @ORM\ManyToOne(targetEntity="Category", inversedBy="children")
     * @ORM\JoinColumn(name="parent_id", referencedColumnName="id", onDelete="CASCADE")
     */
    private $parent;

    /**
     * @ORM\OneToMany(targetEntity="Category", mappedBy="parent")
     * @ORM\OrderBy({"lft" = "ASC"})
     */
    private $children;
}

В чем же проблема

очевидно в автолоадере.

в composer.json добавьте:

{
  "autoload": {
    "psr-4": {
      "": "src/"
    }
  }
}

потом обновите автолоадера
composer --dump-autoloader