Почему медленно открываются сайты через mikrotik с Wireguard?

только disabled=no ))

Почему медленно открываются сайты через mikrotik с Wireguard?

Попробуйте так
/ip firewall mangle
add action=mark-connection chain=prerouting connection-mark=no-mark \
connection-state=new disabled=yes dst-address-list=VPN in-interface=\
bridge new-connection-mark=VPN_conn passthrough=yes
add action=mark-routing chain=prerouting connection-mark=VPN_conn disabled=\
yes in-interface=bridge new-routing-mark=VPN passthrough=no

и перезагрузите роутер

Почему медленно открываются сайты через mikrotik с Wireguard?

anton0211 можете прислать Filter Rules и Mangle?

Почему медленно открываются сайты через mikrotik с Wireguard?

Заголовки WireGuard:
- 20-byte IPv4 header
- 8-byte UDP header
- 4-byte type
- 4-byte key index
- 8-byte nonce
- 16-byte authentication tag

Всего 60. Т.е. если у вас MTU для PPPoE = 1480, то 1480-60=1420
Таким образом, для PPPoE оставляете 1480, для WireGuard можно оставить стандартный 1420

Вот это "если разделить трафик с помощью маркировки" как делаете?

Почему медленно открываются сайты через mikrotik с Wireguard?

протокол у вас может быть не заполнен

Почему медленно открываются сайты через mikrotik с Wireguard?

Я так и подумал, сегодня решал аналогичную проблему. Оказалось дело в fasttrack в правилах firewall filter. Если такое/такие правила есть, нужно в них добавить исключение на интерфейс wireguard