Вам нужно именно по той схеме, что указали: с заменой span на input и сохранением в массив?
Другие варианты редактировать span по двойному клику рассматриваете?
Роман Тузов, угадать - никак, только если вы точно знаете ее продолжительность, если нет то создайте композицию с запасом - 10 минут, например, потом её легко можно будет обрезать по длинне ваших видео дорожек.