Если не хотите изобретать велосипеды, используйте Graphviz. Для PHP, кстати, есть модули. Вариантов его применения - тьма. Экспорт в SVG, PDF, PNG.
www.graphviz.org
www.ffnn.nl/pages/articles/media/uml-diagrams-usin...
Ещё yED умеет нечто похожее, но это больше для рисования руками.