"Почитайте https://dev.1c-bitrix.ru/community/blogs/product_f...
Можно создать все свойства, и разделить для каждой категории что-бы выводились свои" с этой информацией знаком, так и делаю. Вопрос не в том, как организовать удобство. Переживаю, что наполню свойствами все свои категории - инфоблок будет на 1000+ свойств, повлияет ли это на скорость генерации страницы, не станет ли тупить умный фильтр. И вообще какие могут проблемы связанные с производительностью при таком подходе.
