С последнего релиза Django официально поддерживает третий питон.
одной из задач стоит выбор веб-фреймворка для предоставления API сторонней программе (использовать думаю REST). Что лучше всего подойдёт для выбранной задачи, Flask или Django?
В Django как раз есть батарейки для таких вещей. Можно посмотреть в сторону tastypie или django-rest-framework. Нужно отдельно уточнять насчет совместимости конкретной батарейки с третьим питоном.