Matvey

ship и bot_vessel серый потому, что он в своей области видимости не используется после объявления.

Красным ship и cell подчеркиваются потому, что они до момента вызова не были объявлены в области видимости переменных, в которой вы пытаетесь их вызвать.

Почитайте про области видимости переменных.

Сравниваете текст в нижнем регистре
message.text.lower()
с текстом, в котором используется верхний.
'Что ты можешь?'

Условие никогда не выполнится, что логично.

Правильно будет так:
if message.text.lower() == 'что ты можешь?'