Не знаю на сколько это верное решение, но вот что я сделал погуглив ещё немного.
Создал WindowService

public interface IWindowService
    {
        public void ShowWindow<T>(object dataContext) where T : Window, new();
    }

public class WindowService : IWindowService
    {
        public void ShowWindow<T>(object dataContext) where T : Window, new()
        {
            var window = new T
            {
                DataContext = dataContext
            };

            window.Show();
        }
    }

Создал само окно GraphWindow.xaml и его ViewModel - GraphViewModel

А в MainViewModel создал вот такой метод

// PS. ws = WindowService
public void ExecuteShowGraph(object parameter)
        {
            ws.ShowWindow<GraphWindow>(new GraphViewModel(Коллекция точек для графика));
        }