Vladislav

Через фильр pre_get_posts для страницы магазина и архивов прподуктов добавить это условие

'order' => 'DESC', 
        'orderby'   => 'meta_value_num',
        'meta_query' => [
            [
                'relation' => 'OR', 
                array(
                    'key' => '_thumbnail_id', 
                    'compare' => 'NOT EXISTS' 
                ],
                [
                     'key' => '_thumbnail_id', 
                     'compare' => '!NOT EXISTS' 
                ]
            ]